2019冠状病毒病检测

维基百科,自由的百科全书
跳到导航 跳到搜索

2019冠状病毒病检测(英语:COVID-19 testing)是通过核酸抗体抗原英语Rapid antigen test分子检测英语Molecular diagnostics手段[3][4][5][6]及胸腔CT断层成像等临床辅助手段,对人体是否感染2019冠状病毒(SARS-CoV-2)或患有2019冠状病毒病(COVID-19)予以诊断。

2019冠状病毒病检测在2019冠状病毒病疫情中,对于及时诊断、救治患者[3][4][7][8][9][10]疫情监视、恢复经济[11][12][13][5][14][15][16],起着非常重要的作用,被认为是发现、切断传染链的决定性工具。[17] 韩国[18][19]与德国[20]在疫情早期开始的广泛而卓有组织的检测、隔离和接触者追踪英语Contact tracing措施,被认为是其得以较为成功控制冠状病毒疫情的背后原因。 由于病毒携带者可能的无症状感染以及目前尚未开发出可普遍应用的有效疫苗治疗方法英语COVID-19 drug development,充分的COVID-19检测、及时获得检测结果,以及接触者追踪英语Contact tracing疫情监视、感染者隔离控制传染源公共卫生防护措施并配合保持社交距离佩戴口罩英语Face masks during the COVID-19 pandemic个人行为方式的改变英语behavior change (public health),是尽早解脱目前普遍的居家隔离英语Stay-at-home order出行限制英语COVID-19 pandemic lockdowns、从经济衰退状态下安全重启经济的关键。

COVID-19分子与血清检测

COVID-19分子与血清检测的三类方法

人体感染新冠病毒后呼吸道病毒载量及IgMIgG抗体水平与时间关系的示意图[21]
  • 快速抗原检测英语Rapid antigen test:抗原检测应用于检测COVID-19病毒带来的特有的蛋白分子,有速度快的优点,[29][30][14][15] 但也有灵敏度方面的不足:假阴性检测结果的比例较高。[29][22] 快速检测结果为阴性的样品可经由上面提到的PCR核酸检测进一步确认。因抗原检测适合于检测载量大、感染力强的病毒携带者,灵敏度与精确度欠佳[31][32]、但快速出结果的抗原检测近来在控制疫情过程中获得更为广泛的应用。[33][17]

COVID-19病毒检测的采样方法

核酸检测及抗原检测的灵敏度和特异度很大程度上取决于正确的样品采集方法和时机。采样类型包括:上呼吸道标本、下呼吸道英语Respiratory tract#Lower_respiratory_tract标本(痰液、气道抽取物、肺泡灌洗液)、血液、粪便、尿液和结膜分泌物等。[38] 对门诊患者或初期病毒检测,应优先采集上呼吸道样本(鼻腔、喉咙等处取样)[39][40] ;对较严重的呼吸道疾病患者优先采集下呼吸道样本(气管内抽吸或支气管肺泡灌洗)。[40]

鼻咽拭子

上呼吸道 采集样本方法包括:

其中较新的唾液采样方法可由被检测者自己完成,更为快捷、安全。[41]

COVID-19确诊方法

分子检测确诊方法

图为美国疾控中心的SARS-CoV-2病毒检测盒

针对感染SARS-CoV-2的病例,需要实时荧光RT-PCR检测病毒核酸呈阳性才能完全确诊。但是在临床实践中,不排除测试结果呈虚假的反应的可能出现,应结合流行病学接触史和临床特点进行综合分析。[45]这些确诊手段不影响对患有相关症状的病患由医院进行标准的诊断和治疗,确诊为病毒携带者后再会被送至定点医院进行定向治疗。[45][46] 对感染新型冠状病毒的疑似病例进行确诊必须采集相关样本,实时荧光RT-PCR检测新型冠状病毒核酸阳性者可以确诊。在对呼吸道样本或血液样本进行病毒基因测序后,若与已知的新型冠状病毒高度同源,即为确诊病例。[47]若无法透过RT-PCR确诊,则临床上疑似病例须结合流行病学接触史和影像学检查结果等临床特点综合分析。[47]

RT-PCR

RT-PCR测试是现有的对SARS-CoV-2病毒进行检测的主流方式。[45][48]有研究从效率和成本上就这类方式提出其他替代方式,且指出在临床实践中RT-PCR测试针对SARS-CoV-2的劣势。[49][50]在COVID-19患者感染后期,医护人员采用RT-PCR测试复核症状消退的患者是否消除体内病毒。有研究发现有些患者依然存在弥漫性肺泡损伤,其中主要浸润的免疫细胞只有CD68+ 巨噬细胞、CD20+ B细胞以及CD8+ T细胞。[50]因此,尽管利用鼻拭子样本进行的测序显示为阴性,可在病患的肺部组织中发现残留的病毒存在。这一发现建议,针对患者应当更多使用支气管肺泡灌洗液为样本来做PCR,并对已出院的患者跟踪检查。[50]

针对RNA病毒,北京大学清华大学的研究者联合发表了一种新型确认病人感染新型冠状病毒的测序手段SHERRY。这种手段通过基于Tn5转座酶的转录组测序,相比传统的smart-seq2技术有更好的效率,减少了样本的需求量。新型冠状病毒是SHERRY首次在临床上进行应用的对象。[51]

2020年3月12日,瑞士制药罗氏公司宣布该公司基于核酸检测英语Nucleic acid test的商业化检测方法得到了美国食品和药物管理局(FDA)的紧急使用授权英语Emergency Use Authorization[52]。该测试可以在全自动设备上大量进行,极大地提高了检测效率。罗氏表示,利用该公司的cobas 6800&8000分子测试系统,可以在24小时之内检测分别检测1440,4128个样本。[53]

CRISPR

针对SARS-CoV-2常用的检测手段为RT-PCR。[54]有研究认为,现在主要的qRT-PCR检测耗时从获取样本到得出结果超过24小时,因此试图利用CRISPR技术在实践中提供更快的检测。[55]这一研究中开发的DETECTR检测技术基于Cas12蛋白,由于其试剂的便携性认为可以用于在实验室外的地方以提高效率。[55]

影像学检测

对患者使用胸腔断层扫描检查,可观察到影像学异常。早期患者的肺部会呈现多发小斑片影及间质改变,以肺外带明显。经发展后,肺炎患者被观察到双肺多发毛玻璃状病变英语Ground-glass opacity、浸润影。严重者则会进一步发展为次节叶或大叶性肺实变英语Pulmonary consolidation影像表现,胸腔积液少见[56]。有一部分的病人,可能在逆转录聚合酶链式反应测试(RT-PCR)阴性的情形下,在电脑断层上却出现早期典型的肺实变[57]

胸部电脑断层

在胸部电脑断层的检查中,可能有三种较常见的表现,分别为:[58]

  • 双侧周边为主的毛玻璃状病变:约90%[58]
  • 肺部血管增厚(Vascular Thickening):约59%[58]
  • 网状阴影变化(Fine Reticular Opacity):约56%[58]

以下三种表现在COVID-19较为少见表现,需考虑其他肺炎可能性:[58]

相关数据、条目及链接

各国检测相关数据

应用抗体检测与核酸检测对美国COVID-19患者数目的估计

美国疾病控制与预防中心官员依据抗体检测英语Serology#Serological_tests数据估计,截至2020年6月美国正在或曾经罹患COVID-19患者可能达到两千万人,约十倍于经由核酸检测英语Nucleic acid test确诊的官方数字(230万至240万之间)。[59] 但新冠病毒抗体检测的阳性也有一定可能是由普通感冒病毒与新冠抗体的交叉反应英语cross-reactivity引起。[35]

各国次级行政区检测数据

2020年4月,湖北省武昌实验中学组织高三学生免费开展核酸检测 迎接复课
次级行政区 检测数 时间
广东省 24930000 累计截至8月5日[60]
湖北省 6393436 累计截至5月17日[61]
武汉市 9899828 5月14日至6月1日[62]
北京市 11880000 6月11日至7月14日[63]


相关条目

外部链接

参考资料

  1. ^ COVID-19 Dashboard by the Center for Systems Science and Engineering (CSSE) at Johns Hopkins University (JHU). ArcGIS. 约翰·霍普金斯大学. [2020-12-05]. 
  2. ^ WHO COVID-19 Dashboard. WHO.int. 世界卫生组织. [2020-12-04]. 
  3. ^ 3.0 3.1 3.2 3.3 Sheridan, Cormac. Fast, portable tests come online to curb coronavirus pandemic. Nature Biotechnology. 2020-03-23 [2020-03-25]. doi:10.1038/d41587-020-00010-2. (原始内容存档于2020-03-24). 
  4. ^ 4.0 4.1 Coronavirus disease (COVID-19) technical guidance: Laboratory testing for 2019-nCoV in humans. www.who.int. [6 March 2020]. (原始内容存档于2020-01-31). 
  5. ^ 5.0 5.1 5.2 Breaking Down the Two Tests That Could Help Contain the COVID-19 Pandemic: One detects an active infection; another signals that the virus has already left the body. Both are critical for tracking the spread of disease. Smithsonian Magazine. 2020-04-07 [2020-04-08]. (原始内容存档于2020-04-08). 
  6. ^ 6.0 6.1 6.2 Coronavirus testing finally gathers speed
  7. ^ Cohen, Jon; Kupferschmidt, Kai. Countries test tactics in 'war' against COVID-19. Science. 2020-03-20, 367 (6484): 1287–1288 [2020-03-20]. PMID 32193299. doi:10.1126/science.367.6484.1287. (原始内容存档于2020-03-20). 
  8. ^ 8.0 8.1 冠状病毒核酸检测的研究进展与展望. [2020-03-18]. (原始内容存档于2020-03-18). 
  9. ^ 全球遭遇新冠检测难题,多国专家联合支招. [2020-03-18]. (原始内容存档于2020-03-18). 
  10. ^ 10.0 10.1 Everything You Need to Know About Coronavirus Testing: How it works, why we need it, and why it's taking so damn long for the US to get people diagnosed. www.wired.com. [2020-03-26]. (原始内容存档于2020-03-26). 
  11. ^ The lost month: How a failure to test blinded the U.S. to COVID-19. The Seattle Times. 2020-03-28. 
  12. ^ To End The Coronavirus Crisis We Need Widespread Testing, Experts Say. NPR. 2020-03-24 [2020-04-07]. (原始内容存档于2020-04-08). 
  13. ^ 13.0 13.1 13.2 It's Time to Start Testing Coronavirus Immunity: Antibody tests can be faster, easy to administer and easy to scale. www.bloomberg.com. 
  14. ^ 14.0 14.1 Fast COVID-19 test by San Diego's Quidel comes up big in saving Pac-12 football
  15. ^ 15.0 15.1 Covid-19 tests that give results in minutes to be rolled out across world
  16. ^ The case for airport coronavirus testing, and why it matters. [2020-09-28]. (原始内容存档于2020-09-27). 
  17. ^ 17.0 17.1 As Covid-19 Cases Surge, Europe Turns to New Testing Methods
  18. ^ Coronavirus cases have dropped sharply in South Korea. What's the secret to its success?. Science. 2020-03-17 [2020-04-11]. (原始内容存档于2020-03-20). 
  19. ^ Experts Credit South Korea's Extensive Testing For Curbing Coronavirus Spread. NPR.org. [2020-05-23]. (原始内容存档于2020-03-13). 
  20. ^ Pass the salt: The minute details that helped Germany build virus defences. Reuters. 2020-04-09 [2020-04-24]. (原始内容存档于2020-04-22). 
  21. ^ Siouxsie Wiles & Toby Morris: What we don't know about Covid-19. The Spinoff. 6 May 2020 [6 May 2020]. (原始内容存档于2020-08-22). 
  22. ^ 22.0 22.1 22.2 What to know about the three main types of coronavirus tests. CNN. 29 April 2020 [30 April 2020]. (原始内容存档于2020-05-10). 
  23. ^ *Abbott Launches 5-Minute COVID-19 Isothermal Point-of-Care Test 页面存档备份,存于互联网档案馆
  24. ^ Coronavirus Testing Hampered by Disarray, Shortages, Backlogs. Wall Street Journal. 2020-04-19 [2020-04-19]. (原始内容存档于2020-04-19). 
  25. ^ 5分钟出新冠检测结果…美国这个“黑科技”靠谱吗?. 新浪网. 2020-04-24. 
  26. ^ Performance of the rapid Nucleic Acid Amplification by Abbott ID NOW COVID-19 in nasopharyngeal swabs transported in viral media and dry nasal swabs, in a New York City academic institution. [2020-05-13]. (原始内容存档于2020-05-14). 
  27. ^ Prognosis: False Negatives Raise More Questions About Virus Test Accuracy
  28. ^ FDA Cautions About Accuracy Of Widely Used Abbott Coronavirus Test. [2020-05-16]. (原始内容存档于2020-05-16). 
  29. ^ 29.0 29.1 FDA authorizes rapid COVID 19 antigen test: The test is quicker than PCR tests but has a high rate of false negatives. [2020-05-10]. (原始内容存档于2020-05-10). 
  30. ^ Abbott wins U.S. authorization for $5 rapid COVID-19 antigen test
  31. ^ Accuracy Concerns Continue to Surround Rapid Antigen Tests for COVID-19
  32. ^ Covid-19: Innova lateral flow test is not fit for “test and release” strategy, say experts
  33. ^ Public Health Officials Pursue Covid-19 Tests That Trade Precision for Speed. [2020-09-09]. (原始内容存档于2020-09-09). 
  34. ^ 34.0 34.1 Deeks, Jonathan J.; Dinnes, Jacqueline; Takwoingi, Yemisi; Davenport, Clare; Spijker, René; Taylor-Phillips, Sian; Adriano, Ada; Beese, Sophie; Dretzke, Janine; Ferrante di Ruffano, Lavinia; Harris, Isobel M. Antibody tests for identification of current and past infection with SARS-CoV-2. The Cochrane Database of Systematic Reviews. June 25, 2020, 6: CD013652. ISSN 1469-493X. PMID 32584464. doi:10.1002/14651858.CD013652. 
  35. ^ 35.0 35.1 IDSA COVID-19 Antibody Testing Primer Updated: May 4
  36. ^ Researchers Push for Mass Blood Tests as a Covid-19 Strategy. www.wired.com. [2020-03-27]. (原始内容存档于2020-03-27). 
  37. ^ The next frontier in coronavirus testing: Identifying the full scope of the pandemic, not just individual infections. STAT. 27 March 2020 [30 April 2020]. (原始内容存档于2020-06-29). 
  38. ^ 新冠肺炎防治手册:病原学与炎症指标检查 (PDF). [2020-10-01]. (原始内容存档 (PDF)于2020-04-10). 
  39. ^ CDC: Interim Guidelines for Collecting, Handling, and Testing Clinical Specimens for COVID-19
  40. ^ 40.0 40.1 WHO: 利用全球流感监测和应对系统监测COVID-19的操作注意事项
  41. ^ 41.0 41.1 Coronavirus (COVID-19) Update: FDA Issues Emergency Use Authorization to Yale School of Public Health for SalivaDirect, Which Uses a New Method of Saliva Sample Processing. [2020-08-16]. (原始内容存档于2020-08-16). 
  42. ^ 【健康码】粤港澳互认健康码将公布 惟三地核酸检测收费相差近5至7倍 页面存档备份,存于互联网档案馆. HKET. 2020-06-12
  43. ^ 新型冠状病毒测试服务 页面存档备份,存于互联网档案馆. 香港中文大学医务中心
  44. ^ COVID-19 Diagnostics: Performing a Nasopharyngeal and Oropharyngeal Swab 页面存档备份,存于互联网档案馆. AMBOSS: Medical Knowledge Distilled. 2020-03-28
  45. ^ 45.0 45.1 45.2 关于印发新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第七版)的通知. 中华人民共和国国家卫生健康委办公厅. [2020-03-13]. [永久失效链接]
  46. ^ Zhang, Jinnong; Zhou, Luqian; Yang, Yuqiong; Peng, Wei; Wang, Wenjing; Chen, Xuelin. Therapeutic and triage strategies for 2019 novel coronavirus disease in fever clinics. The Lancet Respiratory Medicine. 2020, 8 (3) [2020-03-13]. ISSN 2213-2600. (原始内容存档于2020-02-22) (英语). 
  47. ^ 47.0 47.1 新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案(试行第四版). 中华人民共和国国家卫生健康委员会. [2020-01-27]. 
  48. ^ Guidance | Lab | Diagnostic Assays in Community Preparedness and Response | CDC. CDC. 2019-02-08 [2020-04-30]. (原始内容存档于2020-04-30) (美国英语). 
  49. ^ Lamb, Laura E.; Bartolone, Sarah N.; Ward, Elijah; Chancellor, Michael B. Rapid Detection of Novel Coronavirus (COVID-19) by Reverse Transcription-Loop-Mediated Isothermal Amplification. medRxiv. 2020-02-24 [2020-04-30]. doi:10.1101/2020.02.19.20025155. (原始内容存档于2020-04-30) (英语). 
  50. ^ 50.0 50.1 50.2 Yao, Xiao-Hong; He, Zhi-Cheng; Li, Ting-Yuan; Zhang, Hua-Rong; Wang, Yan; Mou, Huaming; Guo, Qiaonan; Yu, Shi-Cang; Ding, Yanqing; Liu, Xindong; Ping, Yi-Fang; Bian, Xiu-Wu. Pathological evidence for residual SARS-CoV-2 in pulmonary tissues of a ready-for-discharge patient. Cell Research. 2020-04-28 [2020-04-29]. ISSN 1748-7838. doi:10.1038/s41422-020-0318-5. (原始内容存档于2020-04-30) (英语). 
  51. ^ Di, Lin; Fu, Yusi; Sun, Yue; Li, Jie; Liu, Lu; Yao, Jiacheng; Wang, Guanbo; Wu, Yalei; Lao, Kaiqin; Lee, Raymond W.; Zheng, Genhua; Xu, Jun; Oh, Juntaek; Wang, Dong; Xie, X. Sunney; Huang, Yanyi; Wang, Jianbin. RNA sequencing by direct tagmentation of RNA/DNA hybrids. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2020-01-27 [2020-02-02]. ISSN 0027-8424. (原始内容存档于2020-02-02) (英语). 
  52. ^ FDA Emergency Use Authorizations coronavirus2019. Diagnostics. [2020-03-18]. (原始内容存档于2020-02-28) (美国英语). 
  53. ^ Roche Diagnostids. diagnostics.roche.com. [2020-03-18]. (原始内容存档于2020-03-21). 
  54. ^ Wang, Wenling; Xu, Yanli; Gao, Ruqin; Lu, Roujian; Han, Kai; Wu, Guizhen; Tan, Wenjie. Detection of SARS-CoV-2 in Different Types of Clinical Specimens. JAMA. 2020-03-11 [2020-04-21]. doi:10.1001/jama.2020.3786. (原始内容存档于2020-04-21) (英语). 
  55. ^ 55.0 55.1 Broughton, James P.; Deng, Xianding; Yu, Guixia; Fasching, Clare L.; Servellita, Venice; Singh, Jasmeet; Miao, Xin; Streithorst, Jessica A.; Granados, Andrea; Sotomayor-Gonzalez, Alicia; Zorn, Kelsey; Gopez, Allan; Hsu, Elaine; Gu, Wei; Miller, Steve; Pan, Chao-Yang; Guevara, Hugo; Wadford, Debra A.; Chen, Janice S.; Chiu, Charles Y. CRISPR–Cas12-based detection of SARS-CoV-2. Nature Biotechnology. 2020-04-16 [2020-04-21]. ISSN 1546-1696. doi:10.1038/s41587-020-0513-4. (原始内容存档于2020-04-20) (英语). 
  56. ^ 新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案(试行第五版). 2020-02-05. [永久失效链接]
  57. ^ Huang, Peikai; Liu, Tianzhu; Huang, Lesheng; Liu, Hailong; Lei, Ming; Xu, Wangdong; Hu, Xiaolu; Chen, Jun; Liu, Bo. Use of Chest CT in Combination with Negative RT-PCR Assay for the                     2019 Novel Coronavirus but High Clinical Suspicion. Radiology. 2020-02-12, 295 (1): 22–23 [2020-04-03]. ISSN 0033-8419. doi:10.1148/radiol.2020200330. (原始内容存档于2020-04-03). 
  58. ^ 58.0 58.1 58.2 58.3 58.4 58.5 58.6 58.7 58.8 Bai, Harrison X.; Hsieh, Ben; Xiong, Zeng; Halsey, Kasey; Choi, Ji Whae; Tran, Thi My Linh; Pan, Ian; Shi, Lin-Bo; Wang, Dong-Cui. Performance of radiologists in differentiating COVID-19 from viral pneumonia on chest CT. Radiology. 2020-03-10: 200823 [2020-04-03]. ISSN 0033-8419. doi:10.1148/radiol.2020200823. (原始内容存档于2020-04-03). 
  59. ^ Reuters: Coronavirus may have infected 10 times more Americans than reported, CDC says. [2020-06-26]. (原始内容存档于2020-06-28). 
  60. ^ 广州排查高风险国家在穗4355人,均已做核酸检测纳入管理. 澎湃新闻. [2020-04-19]. (原始内容存档于2020-04-22). 
  61. ^ 湖北省累计核酸检测超639万人次 无症状感染者检出率持续降低_滚动新闻_中国政府网. www.gov.cn. [2020-10-11]. 
  62. ^ 武汉核酸检测近990万人 检出300名无症状感染者-新华网. www.xinhuanet.com. [2020-10-11]. 
  63. ^ 北京:全市累计核酸检测已达1188万人-新华网. www.xinhuanet.com. [2020-10-11]. 
  64. ^ “It's like we're flying blind”: The US has a Covid-19 data problem, and fall is fast approaching. [2020-08-09]. (原始内容存档于2020-08-09). 
  65. ^ FDA Authorizes Quest Diagnostics COVID-19 Diagnostic Testing for Specimen Pooling for Emergency Use. [2020-08-08]. (原始内容存档于2020-08-02).