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异裂酶（英語：Neoschizomers）是指识别相同的核酸序列，但酶切位点不同的限制酶，在一些特殊的实验中有很大的应用价值。
例如：
限制酶 MaeII 的酶切位点为 A^CGT
限制酶 TaiI 的酶切位点为 ACGT^
限制酶 ApaI 的酶切位点为 GGGCC^C
限制酶 Bsp120I 的酶切位点为 G^GGCCC
以及其它一些例子。
识别相同序列，酶切位点也相同的限制酶称为同裂酶。
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