海軍奉行（日語：かいぐんぶぎょう）為幕末江戸幕府所設置之公職。薪俸5000石。
1865年（慶應元年）所設置之官職。初代為下野黒羽藩大關增裕。翌年為輔佐海軍奉行、設立「海軍奉行並」一職。海軍奉行為軍艦奉行之上級、可以領導幕府海軍。1866年（慶應2年）常設海軍總裁一職、海軍奉行為其下級。
