醫林改錯
王清任強調“業醫診病，當先明臟腑”，他親自去墳場、刑場觀察屍體。
道光十年（1830年）撰成《醫林改錯》二卷，約3萬餘字，並繪有25幅臟腑圖譜。
内容
王清任企圖建立「氣」、「血」系統，兩者不相通，血管中只流血，氣管中只行氣，主張心臟是氣管通路，認為心中無血。
《醫林改錯》內「活血化瘀」的方劑有二十二例，如五逐瘀汤（血府逐瘀湯、膈下逐瘀湯、少腹逐瘀湯、身痛逐瘀湯、通竅活血湯）、补阳还五汤等，被稱為活血化瘀派的宗師。
评价
《醫林改錯》在醫學界褒贬不一，有人說是“集數十載之精神，考正數千年之遺誤”， 是“稀世之寶”；也有醫家認為是“醫林改錯，越改越錯”。（例如：《內經》認為尿液是食物中的水液進入大腸後，循下焦滲入膀胱。王清任卻批評說：“尿從糞中滲出，其氣當臭，嘗用童子小便，並問及自飲小便之人，只言味鹹，其氣不臭……”，又谓“中风者半身无气，半身有气者”）
《医林改错》否认三焦，认为本无其事物。王清任雖然實地觀察屍體，堅持“親見臟腑”，卻缺乏“系統的實驗”精神，亦乏“操作典範”，僅僅是动目而不动手，使得書中的結論過於草率，因此嚴重影響到本書的價值。
參考書目
- 王道還，〈論醫林改錯的解剖學〉，《新史學》，1995，第六卷第一期，頁 95－112。
- Nathan Sivin，Traditional medicine in contemporary China.（Ann Arbor，1987）.