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普通细菌孔道蛋白家族

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革兰氏阴性菌孔道蛋白
鉴定
标志Porin_1
PfamPF00267旧版
Pfam宗系CL0193旧版
InterPro英语InterProIPR001702
PROSITE英语PROSITEPDOC00498
SCOP英语Structural Classification of Proteins1mpf / SUPFAM
TCDB英语TCDB1.B.1
OPM英语Orientations of Proteins in Membranes database家族31
OPM英语Orientations of Proteins in Membranes database蛋白1pho
CDD英语Conserved Domain Databasecd01345

普通细菌孔道蛋白一类英语Protein family存在于革兰氏阴性菌外膜上的蛋白质。这类蛋白充当了对亲水性物质的分子过滤器[1],在外膜上起着“分子筛”的作用。这些蛋白生成的装满水的通道可让亲水性物质进入周质空间中。部分孔道蛋白生成的扩散通路可允许大小小于排阻极限的溶质通过,而另一些则在孔道内有特异性的结合位点,只能允许一种溶质通过。孔道蛋白是细菌外膜上的一种主要蛋白质,噬菌体细菌素英语Bacteriocin常常会通过它们与细菌结合。

细菌孔道蛋白常常会结合成三聚体英语Protein trimer。而它们的β链则是这些蛋白质的跨膜核心[2]。有证据表明[3]一些孔道蛋白与净化有关。这些蛋白质有:

亚家族

参考

  1. ^ Benz R, Bauer K. Permeation of hydrophilic molecules through the outer membrane of gram-negative bacteria. Review on bacterial porins. Eur. J. Biochem. 1988, 176 (1): 1–19. PMID 2901351. doi:10.1111/j.1432-1033.1988.tb14245.x. 
  2. ^ Jap BK, Walian PJ. Biophysics of the structure and function of porins. Q. Rev. Biophys. 1990, 23 (4): 367–403. PMID 2178269. doi:10.1017/S003358350000559X. 
  3. ^ Pattus F, Jeanteur D, Lakey JH. The bacterial porin superfamily: sequence alignment and structure prediction. Mol. Microbiol. 1991, 5 (9): 2153–2164. PMID 1662760. doi:10.1111/j.1365-2958.1991.tb02145.x.