DNA結合位點
DNA結合位點(英語:DNA binding sites)是存在於DNA上的與其它分子相綁定的各類結合位點。
DNA結合位點與其它結合位點的區別在於:
- 它們是DNA序列(如一個基因組)中的一部分;
- 它們被DNA結合蛋白所綁定。
DNA結合位點常常與一類被稱為轉錄因子的特殊蛋白相聯繫起來,並因此聯繫到轉錄調控。針對特定的一個轉錄因子的DNA結合位點總和常被命名為該轉錄因子的順反組。DNA結合位點也包括了其它蛋白的靶點,如限制性核酸內切酶、位點特異性重組酶(見位點專一重組)及甲基轉移酶類[1]。
因此,DNA結合位點可被定義為:特異性地被一種或多種DNA結合蛋白或蛋白複合物所結合的一段短DNA序列(典型的是4~30個鹼基長,對重組位點來說則長達200bp)。
另見
參考文獻
- ^ Halford E.S, Marko J.F. How do site-specific DNA-binding proteins find their targets?. Nucleic Acids Research. 2004, 32 (10): 3040–3052. PMC 434431
. PMID 15178741. doi:10.1093/nar/gkh624.
深入閱讀
- Teif VB, Rippe K. Calculating transcription factor binding maps for chromatin.. Briefings in Bioinformatics. 2012, 13 (2): 187–201. PMID 21737419. doi:10.1093/bib/bbr037.
- Moss T. DNA-protein interactions: principles and protocols 2. Humana Press. 2001. ISBN 978-0-89603-671-0.
- ENCODE threads Explorer(頁面存檔備份,存於網際網路檔案館) Transcription factor motifs at the Nature (journal)