硒化合物是含有硒元素的化合物，在這些化合物中，硒有着多種氧化態，最常見的是−2、+4和+6。硒化合物在自然界中以各種礦物的形式存在，也可以和黃鐵礦、黃銅礦等硫化物礦物共生。對很多哺乳動物來說，硒化合物是必不可少的，如硒甲硫氨酸和硒半胱氨酸是人體內存在的含硒氨基酸，硒甲硫氨酸參與硒蛋白的合成，而硒半胱氨酸的還原電位和pKa比半胱氨酸要低，使一些蛋白具有抗氧化活性。硒化合物在半導體材料、玻璃及陶瓷工業、醫藥、冶金等領域有着重要應用。
