1. 外交部 部長：錢其琛 2. 國防部 部長：秦基偉（兼） 3. 國家計劃委員會 主任：姚依林 → 鄒家華（兼） 4. 國家經濟體制改革委員會 主任：李鵬（兼） → 陳錦華 5. 國家教育委員會 主任：李鐵映（兼） 6. 國家科學技術委員會 主任：宋健（兼） 7. 國防科學技術工業委員會 主任：丁衡高 8. 國家民族事務委員會 主任：司馬義·艾買提（維吾爾族） 9. 公安部 部長：王芳（兼） → 陶駟駒 10. 國家安全部 部長：賈春旺 11. 監察部 部長：尉健行 12. 民政部 部長：崔乃夫 13. 司法部 部長：蔡誠 14. 財政部 部長：王丙乾（兼） → 劉仲藜 15. 人事部 部長：趙東宛 16. 勞動部 部長：羅幹 → 阮崇武 17. 地質礦產部 部長：朱訓 18. 建設部 部長：林漢雄 → 侯捷 19. 能源部 部長：黃毅誠 20. 鐵道部 部長：李森茂 → 韓杼濱 21. 交通部 部長：錢永昌 → 黃鎮東
22. 機械電子工業部 部長：鄒家華（兼） → 何光遠 23. 航空航天工業部 部長：林宗棠 24. 冶金工業部 部長：戚元靖 25. 化學工業部 部長：秦仲達 → 顧秀蓮（女） 26. 輕工業部 部長：曾憲林 27. 紡織工業部 部長：吳文英（女） 28. 郵電部 部長：楊泰芳 29. 水利部 部長：楊振懷 30. 農業部 部長：何康 → 劉中一 31. 林業部 部長：高德佔 32. 商業部 部長：胡平 33. 對外經濟貿易部 部長：鄭拓彬 → 李嵐清 34. 物資部 部長：柳隨年 35. 文化部 部長：王蒙 → 賀敬之（代） → 劉忠德（代） 36. 廣播電影電視部 部長：艾知生 37. 衛生部 部長：陳敏章 38. 國家體育運動委員會 主任：李夢華 → 伍紹祖 39. 國家計劃生育委員會 主任：彭珮雲（女） 40. 中國人民銀行 行長：李貴鮮（兼） 41. 審計署 審計長：呂培儉
