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變形古菌界

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變形古菌界
受到病毒STSV-1英语STSV-1感染的硫化葉菌属
科学分类 编辑
域: 古菌域 Archaea
界: 變形古菌界 Proteoarchaeota
Petitjean et al. 2014
超門與門[1]
異名
  • Crenarchaeida Luketa 2012
  • Crenarchaeota Woese, Kandler & Wheelis 1990

變形古菌界(Proteoarchaeota)是一個提議中的、位於古菌域中的,而這個界的生物被認為與真核生物相關。[2][3][a]

分類

這類群的系統發生學關係尚在討論階段,而各類群成員間的關係如下所示:[4][5][6][7]

變形古菌界
TACK超門

初古菌門

泉古菌門

曙古菌門(Aigarchaeota)

地古菌門(Geoarchaeota)

奇古菌門(Nitrososphaerota)

深古菌門(Bathyarchaeota)

阿斯加德古菌超門

洛基古菌門

奧丁古菌門

索爾古菌門

海姆達爾古菌門

(+ α-變形菌)

真核生物

註解

  1. ^ 這類群有時又稱作TACK;而TACK的名稱來自奇古菌門(Nitrososphaerota)、曙古菌門(Aigarchaeota)、泉古菌門(Crenarchaeota)、及初古菌門(Korarchaeota)這四個早期發現的子類群名稱的首字母縮寫。由於這類群的系統發生未解決之故,因此變形古菌及TACK這兩個名稱有可能會在重新分類後變得不同。

參考資料

  1. ^ Castelle CJ, Banfield JF. Major New Microbial Groups Expand Diversity and Alter our Understanding of the Tree of Life. Cell. 2018, 172 (6): 1181–1197. PMID 29522741. doi:10.1016/j.cell.2018.02.016可免费查阅. 
  2. ^ Petitjean, C.; Deschamps, P.; López-García, P.; Moreira, D. Rooting the domain Archaea by phylogenomic analysis supports the foundation of the new kingdom Proteoarchaeota. Genome Biol. Evol. 2014, 7 (1): 191–204. PMC 4316627可免费查阅. PMID 25527841. doi:10.1093/gbe/evu274. 
  3. ^ Eugene V. Koonin. Archaeal ancestors of Eukaryotes: Not so elusive any more. BMC Biology. 2015, 13 (1): 84. PMC 4594999可免费查阅. PMID 26437773. doi:10.1186/s12915-015-0194-5. 
  4. ^ Spang, Anja; Saw, Jimmy H.; Jørgensen, Steffen L.; Zaremba-Niedzwiedzka, Katarzyna; Martijn, Joran; Lind, Anders E.; van Eijk, Roel; Schleper, Christa; Guy, Lionel; Ettema, Thijs J.G. Complex archaea that bridge the gap between prokaryotes and eukaryotes. Nature. 2015, 521 (7551): 173–179. Bibcode:2015Natur.521..173S. PMC 4444528可免费查阅. PMID 25945739. doi:10.1038/nature14447. 
  5. ^ Zaremba-Niedzwiedzka, Katarzyna; Caceres, Eva F.; Saw, Jimmy H.; Bäckström, Disa; Juzokaite, Lina; Vancaester, Emmelien; Seitz, Kiley W.; Anantharaman, Karthik; Starnawski, Piotr; Kjeldsen, Kasper U.; Stott, Matthew B.; Nunoura, Takuro; Banfield, Jillian F.; Schramm, Andreas; Baker, Brett J.; Spang, Anja; Ettema, Thijs J.G. Asgard archaea illuminate the origin of eukaryotic cellular complexity. Nature. 2017, 541 (7637): 353–358 [2022-07-27]. Bibcode:2017Natur.541..353Z. OSTI 1580084. PMID 28077874. S2CID 4458094. doi:10.1038/nature21031. (原始内容存档于2019-12-05). 
  6. ^ Zaremba-Niedzwiedzka, Katarzyna; et al. Asgard archaea illuminate the origin of eukaryotic cellular complexity. Nature. 19 January 2017, 541 (7637): 353–358 [2022-07-27]. Bibcode:2017Natur.541..353Z. OSTI 1580084. PMID 28077874. S2CID 4458094. doi:10.1038/nature21031. (原始内容存档于2019-12-05). 
  7. ^ Fournier, Gregory P.; Poole, Anthony M. A briefly argued case that Asgard Archaea are part of the Eukaryote tree. Frontiers in Microbiology. 2018, 9: 1896. ISSN 1664-302X. PMC 6104171可免费查阅. PMID 30158917. doi:10.3389/fmicb.2018.01896可免费查阅 (英语).