嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒2型Mu變異株

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2019冠状病毒病疫情
科學準確的 SARS-CoV-2 外部結構原子模型。 每個“球”都是一個原子。
科學準確的 SARS-CoV-2 外部結構原子模型。 每個“球”都是一個原子。
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2019冠狀病毒病主题

嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒2型-Mu變異株（英語：SARS-CoV-2 Mu variant），別名B.1.621譜系 （英語：Lineage B.1.621），是嚴重急性呼吸綜合症冠狀病毒2型（SARS-CoV-2）的一種變異株。於2021年七月在哥倫比亞被發現並在同年8月30日被WHO標示為「需留意變異株」（VOI）。[1]WHO稱這個變種擁有可能使疫苗失效的突變，並表示必須深入研究以徹底了解此種變異株。[2]Mu變異株已被通報在南美洲與歐洲擴散。[3]

B.1.621譜系擁有一個子譜系，依PANGO命名規則編號為B.1.621.1， 目前已被發現散布到全世界20餘國。[4]

命名

2021年一月，此變異株首度在哥倫比亞被發現，並被命名為 B.1.621。[5]

7月1日，英國公共衛生部（英语：Health Protection Agency）將 B.1.621 命名為VUI-21JUL-1。[6]

8月30日，世界衛生組織將 B.1.621 命名為Mu變異株。[1]

變異

Mu變異株的基因體擁有21個突變位，包括9個胺基酸突變，棘蛋白編號分別為: T95I、Y144S、Y145N、R346K、E484K，以及逃脫變異N501Y、D614G、P681H、以及D950N。[7]病毒突變並不罕見。每一種病毒，包括SARS-CoV-2，每隔一段時間就會變化。 大部分的突變是無關緊要的，但一些突變可以增強病毒的威力或對藥物、疫苗產生免疫逃避（英语：antigenic escape）。[3] 一項在羅馬一間實驗室進行的研究[8]測試了輝瑞-BioNTech疫苗對Mu變異株的療效，並發現: 雖然Mu變異株在棘蛋白上有許多突變，輝瑞疫苗仍能有效將其消滅。而相較於其他變種株，輝瑞疫苗雖然有效，但其誘發的抗體消滅Mu變異株的效果大大減弱。[5]

  • SARS-CoV-2 Mu變異株基因體棘蛋白部分的胺基酸變異圖[9]
    SARS-CoV-2 Mu變異株基因體棘蛋白部分的胺基酸變異圖[9]
Mu變異株變異特徵[7]
基因編號 突變之胺基酸編號
ORF1a T1055A
T1538I
T3255I
Q3729R
ORF1b P314L
P1342S
棘蛋白(S) T95I
Y144S
Y145N
R346K
E484K
N501Y
D614G
P681H
D950N
ORF3a Q57H
del257/257
ORF8 T11K
P38S
S67F
核殼蛋白(N) T205I

歷史

2021年8月

8月30日，日本宣布確診境內首兩例Mu變異株患者，分別是一名40歲左右的女性，於8月26日自阿拉伯聯合大公國入境。另一名為50多歲女性，於7月5日由英國入境。此兩例皆為無症狀感染者。[10]

2021年9月

9月2日:

  • 中華民國中央流行疫情指揮中心宣布發現臺灣第一例Mu變種株確診個案，為一位60多歲本國籍女性，自美國入境，且已接種2劑輝瑞疫苗。她在7月5日於美國接種第一劑輝瑞疫苗，並於7月26日接種第二劑。當她於8月3日返國時，起先並未回報有任何症狀，後於機場檢疫時確診COVID-19。[11][12]
  • 瓜地馬拉通報境內首兩例女性Mu變異株患者，分別為19及25歲。兩名患者皆無旅遊史與疫苗接種史。病人隨即被安置在位於瓜地馬拉市的醫院。[13]

9月3日:

  • 希臘通報境內首六例Mu變異株確診案例。其中四例為境外移入。[14]
  • 香港通報境內首三例Mu變異株確診案例。其中兩例為19歲男性與22歲女性，曾入境瓜地馬拉，確認在六月初時就已感染Mu變異株，另一26歲女性，自美國入境，於7月24日確診。香港同時也新增了四例境外移入COVID-19病例，皆為由菲律賓入境之移工。[15]
  • 南韓通報境內首三例Mu變異株確診案例。疾病管理廳宣布確診3例由墨西哥、美國及哥倫比亞入境之境外移入病例。[16]

9月4日:

  • 愛爾蘭健康保護監測中心(HPSC)通報境內四例Mu變異株確診案例。其中兩例病例與 B.1.621.1 有關。[17]


統計數據

各國確診個案(截至2021年9月6日)
國家 病例數
來自GISAID[18] 來自outbreak.info[7] 來自其他來源
 美國 2,400 2,216
 哥伦比亚 965 877
 西班牙 512 512
 墨西哥 367 357
 厄瓜多尔 170 170
 阿鲁巴 84 84
 義大利 82 77
 智利 84 73
 荷蘭 75 72 44[19]
 英国 61 55 53[20]
 波多黎各 – 51
 奥地利 49 49
 哥斯达黎加 49 49
 瑞士 48 48
 加拿大 114 69
 多米尼加 46 46
 比利時 36 36
 葡萄牙 24 24
 英屬維爾京群島 21 21
 库拉索 20 20
 德國 14 14
 秘魯 14 14
 法國 21 16
 巴西 11 11
 荷蘭加勒比區 8 8
 丹麥 7 7
 波蘭 6 6
 委內瑞拉 5 5
 愛爾蘭 4 4 4[17]
 芬兰 3 3
 荷屬聖馬丁 3 3
 斯洛伐克 3 3
 瑞典 4 4
 开曼群岛 2 2
 香港 2 2 3[15]
 日本 2 2 2[10]
 土耳其 2 2
 巴巴多斯 1 1
 直布罗陀 1 1
 以色列 1 1
 列支敦斯登 1 1
 盧森堡 2 2
 馬爾他 1 1
 羅馬尼亞 1 1
 韩国 1 1 3[16]
 特克斯和凯科斯群岛 1 1
 希臘 – – 6[14]
 危地马拉 – – 2[13]
 臺灣 – – 1[11]
共計: 5,328 5,022 118

參見

参考文献

  1. ^ 1.0 1.1 Tracking SARS-CoV-2 variants. who.int. World Health Organization. [September 1, 2021]. （原始内容存档于2021-06-18） （英语）. 
  2. ^ WHO monitoring new coronavirus variant named 'Mu'. france24.com. September 1, 2021 [September 1, 2021]. （原始内容存档于2021-09-01） （英语）. 
  3. ^ 3.0 3.1 Why Has WHO Designated 'Mu' A Variant Of Concern? Find Out All About It. ndtv.com. September 1, 2021 [September 1, 2021]. （原始内容存档于2021-09-01） （英语）. 
  4. ^ Lineage B.1.621.1. cov-lineages.org. [September 1, 2021]. （原始内容存档于2021-08-31） （英语）. 
  5. ^ 5.0 5.1 Mu COVID variant: All you need to know about the new UK coronavirus strain. BBC Science Focus Magazine. [2021-09-01]. （原始内容存档于2021-09-01） （英语）. 
  6. ^ Variants: distribution of cases data. gov.uk. Government Digital Service. [September 1, 2021]. （原始内容存档于2021-06-07）. 
  7. ^ 7.0 7.1 7.2 Mu Lineage Report. outbreak.info. [September 1, 2021]. （原始内容存档于2021-09-01）. 
  8. ^ Messali, S., Bertelli, A., Campisi, G., Zani, A., Ciccozzi, M., Caruso, A. and Caccuri, F.(2021). A cluster of the new SARS-CoV-2 B.1.621 lineage in Italy and sensitivity of the viral isolate to the BNT162b2 vaccine.. Journal of Medical Virology. [2020-09-04]. 
  9. ^ SARS-CoV-2 variants - Stanford Coronavirus Antiviral & Resistance Database. covdb.stanford.edu. Stanford University Coronavirus Antiviral & Resistance Database. [September 1, 2021]. （原始内容存档于2021-06-30）. 
  10. ^ 10.0 10.1 Japan confirms first cases of mu variant of COVID-19. thebharatexpressnews.com. September 2, 2021 [September 2, 2021]. （原始内容存档于September 2, 2021）. 
  11. ^ 11.0 11.1 Taiwan reports its 1st imported case of Mu COVID variant. Taiwan News. September 3, 2021 [September 3, 2021]. （原始内容存档于2021-11-27）. 
  12. ^ 疾管署. 新增19例COVID-19確定病例，分別為16例本土及3例境外移入. 2021-08-03 [2021-09-04]. 
  13. ^ 13.0 13.1 The “MU” variant is already in Guatemala. Is it immune to vaccines?. bullfrag.com. [September 4, 2021]. （原始内容存档于2021-11-27） （英语）. 
  14. ^ 14.0 14.1 Κορονοϊός - Μετάλλαξη Mu: Έξι κρούσματα στην Ελλάδα - Πού εντοπίστηκαν. ethnos.gr. [September 3, 2021]. （原始内容存档于2021-09-03） （希腊语）. 
  15. ^ 15.0 15.1 Coronavirus: three cases of new Mu variant found in Hong Kong arrivals, authorities reveal. South China Morning Post. [September 3, 2021]. （原始内容存档于2021-11-27） （英语）. 
  16. ^ 16.0 16.1 3 Mu variant cases detected in South Korea. malaysianow.com. September 3, 2021 [September 4, 2021]. （原始内容存档于2021-09-04） （英语）. 
  17. ^ 17.0 17.1 Neville, Steve. Four Covid cases associated with Mu variant identified in Ireland. Irish Examiner. 4 September 2021 [5 September 2021]. （原始内容存档于2021-11-27）. 
  18. ^ Tracking of Variants. gisaid.org. [September 5, 2021]. （原始内容存档于2021-06-23）. 
  19. ^ Variants of the coronavirus SARS-CoV-2. rivm.nl. [September 4, 2021]. （原始内容存档于2021-07-09）. 
  20. ^ Variants: distribution of case data, 3 September 2021. gov.uk. Government Digital Service. [September 4, 2021]. （原始内容存档于2021-09-03）. 
SARSr-CoV
SARS-CoV-1相關病毒
人類病毒
蝙蝠病毒
HKU3 · Rm1 · Rf1 · Rp3 · Rs672 · SHC014 · WIV1 · LYRa11 · YNLF 31C · YNLF 34C · WIV16 · 16BO133
其他
SARS-CoV-2相關病毒
人類病毒
變異株
需要关注的变异株（英语：SARS-CoV-2 variant of concern）（VOC）
Omicron（B.1.1.529）
子谱系：BA.1、BA.1.1、BA.2、BA.2.10.1、BA.2.12、BA.2.12.1、BA.2.75、BA.2.75.2、BA.2.86、BA.3、BA.4、BA.5、BA.5.2.1、BF.7、BQ.1、BQ.1.1、CH.1.1、EG.5、EG.5.1、JN.1、XBB、XBB.1、XBB.1.5、XBB.1.9.2、XBB.1.16、XBF、XE（西班牙语：Variante XE del SARS-CoV-2）
原需要关注的变异株
Alpha（B.1.1.7）（带E484K版本）（書面挪威語：Lineage B.1.1.7 with E484K） · Beta（B.1.351） · Gamma（P.1） · Delta（B.1.617.2）
原需要留意的变异株（阿拉伯语：متحور مثير للاهتمام）（VOI）
及监视下的变异株（阿拉伯语：متحور قيد المراقبة）（VUM）
Zeta（英语：SARS-CoV-2 Zeta variant）（P.2） · Theta（英语：SARS-CoV-2 Theta variant）（P.3） · Epsilon（英语：SARS-CoV-2 Epsilon variant）（B.1.427、B.1.429（書面挪威語：Lineage B.1.429）、CAL.20C） · Kappa（B.1.617.1） · Iota（英语：SARS-CoV-2 Iota variant）（B.1.526） · Eta（英语：SARS-CoV-2 Eta variant）（B.1.525） · Lambda（C.37） · Mu（B.1.621）
曾監視的變異株（FMV）
AV.1 · AT.1 · R.1（西班牙语：Variante R.1 del SARS-CoV-2） · B.1.466.2 · B.1.1.519 · C.36.3 · B.1.214.2 · B.1.1.523（西班牙语：B.1.1.523） · B.1.619 · B.1.620（書面挪威語：Lineage B.1.620） · B.1.1.318（書面挪威語：Lineage B.1.1.318）/AZ.5 · C.1.2（他加禄语：SARS-CoV-2 Lineage C.1.2） · B.1.630 · B.1.640 · XD
其他变种
B.1.1.207（書面挪威語：Lineage B.1.1.207） · B.1.1.317 · B.1.616（書面挪威語：Den bretonske koronavarianten） · B.1.618（書面挪威語：Lineage B.1.618） · B.1.640.2（德语：B.1.640.2） · Deltacron（書面挪威語：«Deltacron»） · XF · Cluster 5（英语：Cluster 5）（已消亡）
错义突变
del 69-70 · RSYLTPGD246-253N · N440K · G446V · L452R（書面挪威語：Mutasjon L452R） · Y453F · S477G/N · E484Q（書面挪威語：Mutasjon E484Q） · E484K（書面挪威語：Mutasjon E484K） · F490S · N501Y（書面挪威語：Mutasjon N501Y） · N501S · D614G（書面挪威語：Mutasjon D614G） · Q677P/H · P681H（書面挪威語：Mutasjon P681H） · P681R（書面挪威語：Mutasjon P681R） · A701V（書面挪威語：Mutasjon A701B og mutasjon A701V）
蝙蝠病毒
RaTG13 · RmYN02 · RacCS203（英语：RacCS203） · RshSTT182 · RshSTT200 · ZC45 · ZXC21 · Rc-o319
其他
穿山甲冠狀病毒（GD · GX · Pangolin-CoV-2020）
其他
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Ghana348相關 · HKU9 · BtKY18樣 · BtHp-BetaCoV/ZJ2013
SARS-CoV-2（病毒株）· COVID-19（疾病）· 全球大流行（世界卫生组织定級）
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