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自然主义通常是指继承唯物主义和实用主义衣钵、不探究自然界中超自然因素的哲学立场，其理論基礎認為所有現象皆可用自然理由的概念解釋。自然主义不一定认为超自然现象和假设不存在或就是荒谬，但是所有的现象和假设必须可以用相同的方法来研究，因此任何超自然事物或是不存在，或是不可知，或是与自然现象和假设没有本质区别。
任何限制于自然、物理、唯物方法和解释范围内的探索和调查手段，或者积累知识的过程，都可归入自然主义。
许多科学哲学家用“方法自然主义”（又译“方法论自然主义”，“自然方法论”）和“科学自然主义”来指科学方法中被长久广为遵循的常规，即使用方法论假设可观察的自然现象只能由自然原因来解释，而不假设超自然能力是否存在，因此也不接受超自然的解释。与“存在论自然主义”或“形上學自然主義”相对，这些思想认为：自然界（包括整个宇宙）就是存在的全部，因此超自然事物是不存在的。
这是由支持科学和演化论的哲学家提出，他们在“创造论对演化论的争议”中反对创造论或智能设计论，把“方法论自然主义”称为“科学唯物主义”或者“方法论唯物主义”，与“形而上学自然主义”结合，进一步支持他们提出的“现代科学是无神论”的理念。与其相对的自然哲学手段则接受对自然现象的超自然解释，从而被称为“有神论科学”或伪科学。
无神论（英語：Atheism），在廣義上，是指一種不相信神存在的觀念；在狹義上，無神論是指對相信任何神存在的一種抵制。無神論與通常至少相信一種神存在的有神論形成一个對比。
无神论一词源起于古希臘語ἄθεος，最初指的是对较广为接受的宗教所持有的否定态度，但随着自由思想和科學懷疑論的传播，以及对宗教的批评的增多，这一词语的对象范围也逐渐狭窄起来。第一个自称为“无神论者”的人出现在18世纪。法國大革命是歷史上的第一次與无神论有關的大型政治運動，其倡導人們理性至上。 无神论者不相信神的常见理据包括没有经验证据支持；罪恶问题、启示不一致论证、神的不可證伪性及无信仰论证。此外也有许多从哲学、社会学、历史学等角度出发的不同的无神论论证。尽管很多无神论者的思想都倾向各种世俗哲学（例如人文主义、理性主义和自然主义），但无神论者之间并没有一个共同的思想体系。許多無神論者認為，無神論是一种較有神論簡約的世界觀，因此，駁斥上帝存在的舉證責任不在無神論者身上。但是，從有神論者的立場來看，這是有神存在的理由。
由於無神論的概念有所不同，而且在許多地區，自稱無神論者往往會受到其他宗教信徒的排擠、 歧視甚至攻擊，因此無神論人口難以估計。若干探討相關問題的全球綜合調查是由蓋洛普國際進行：他們2015年中訪問超過64,000人的調查指出，11％的人是「堅定的無神論者」，而較早的2012年調查發現，13％受訪者是「堅定的無神論者」。由英國廣播公司於2004年進行的一個調查顯示，無神論者为全世界人口的8％。其他較舊的估計顯示，無神論者佔世界人口的2％，而無宗教信仰的則進一步佔12％,在已開發國家中,較能允許自由開放與批判性思想, 所以通常無神論者比例也較高。
根據最近很多研究顯示：教育程度和智力測驗越高的受試者中，無神論者的比例比一般人高，尤其是從事科學方面的研究者占最高比例。